El 10 de enero de 1999, el Consejo de Ancianos de la Iglesia de Cristo Ebenezer reconoció el apostolado del hermano Sergio Enríquez, quien había servido como pastor en la Iglesia de Cristo Ebenezer durante 15 años. En febrero del mismo año, los ministros de diferentes ministerios en la ciudad de Guatemala realizaron un reconocimiento público del hermano Sergio Enríquez como apóstol. De esta manera, nació Ministerios Ebenezer, con la visión de compartir el pan con el hambriento, vestir al desnudo y recibir en casa a los que no tienen adónde ir, según lo que el Señor habló en Isaías 58.

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Profetas y Apóstoles de diferentes países han reconocido el ministerio, confirmando el llamado de Dios para el Apóstol Sergio EnrÍquez, así como para las ovejas de la Iglesia de Cristo Ebenezer, quienes ahora forman parte de Ministerios Ebenezer.

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Actualmente, Ministerios Ebenezer cubre más de 700 iglesias alrededor del mundo, de las cuales 30 están en diferentes ciudades de Estados Unidos. El Apóstol Sergio Enríquez creció bajo el apostolado del hermano Ottoniel Ríos Paredes y, durante muchos años, viajó como delegado apostólico para resolver diversos problemas en diferentes países. Fue miembro del Consejo Consultivo del Apóstol Ríos.

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Las señales que caracterizan a un apóstol se manifestaron en la vida del apóstol Enriquez, quien vio al Señor Jesús en 1978 y recibió el testimonio del Espíritu constantemente a partir de 1989. Tuvo revelación doctrinal y ha sufrido y llorado por la obra. Aun sin ser un ministerio formal, la Iglesia Ebenezer creció grandemente y dio cobertura a varias iglesias, engendrando ministros.